操作气相色谱仪如何选用不同气体纯度的气源做载气和辅助气体，是一个老的技术问题。下面介绍对气体纯度选择的一般原则。
1.从分析角度讲，微量分析比常量分析要求高，也就是说，气体中的杂质含量必须低于被分析组分的含量，如果用TCD分析10ppm的CO，则载气中的杂质总含量不得超过10ppm，因为99.999%纯度的气体则含0.001%的杂质，相当于10ppm所以对于10ppm的痕量分析，载气的纯度应高于99.999%；
对于FID使用气体，碳氢化合物含量必须很低，载气中的大量氧杂质只要不对色谱柱造成影响，就不影响FID的性能，而操作ECD，载气中的氧气和水的含量必须很低等。
2.毛细管柱分析比填充柱分析要求高；
3.程序升温分析比恒定温度分析要求高；
4.浓度型检测器比质量型检测器要求高；
5.配有甲烷装置的FID比单FID操作的对载气中的微量CO，CO2要求要高的多；
6.从仪器寿命和保持仪器的高灵敏度讲，中仪器比低当仪器要求高。
